Однако рельефы ворот явно выглядят западноевропейскими и сопровождаются надписями на латыни, а не на греческом языке. Существует несколько версий о том, как ворота появились в Новгороде. Одна из теорий предполагает, что они были привезены после разграбления собора в Плоцке литовцами в XIII веке во время военного похода в Мазовии. Другая версия предполагает, что это был подарок польского духовенства новгородскому князю.
Наиболее интересна версия о том, что ворота были привезены как трофей из шведского города Сигтуны в 1187 году. Однако даже эта версия вызывает вопросы: неясно, кто именно разрушил Сигтуну. Новгородские летописи молчат, а западные источники сначала называли нападавших просто «язычниками», и лишь через три века очередная хроника утверждает, что нападение совершили карелы и новгородцы. В более поздних источниках упоминаются эсты, и различные народы фигурируют в разных сочетаниях.
Однако Магдебургские ворота были созданы специально для Новгорода. Этот город в то время был немецкой торговой факторией, а ворота предназначались для одного из католических храмов которых было несколько в Новгороде. Это объясняет католические символы и надписи на латыни. Версия о том, что ворота были военным трофеем, не столь правдоподобна в этом контексте.
Ворота были изготовлены специально для католической церкви, которая должна была стать важным элементом немецкой торговой фактории. Католики активно строили свои храмы на территориях, где велась торговля, и Новгород был одной из таких ключевых точек. Композиция ворот хоть и была частично изменена, но в целом сохранилась, что подтверждает их создание для конкретного архитектурного проекта в Новгороде.
Таким образом, Магдебургские ворота попали в Новгород как часть европейской католической культуры и торговой жизни города, который на тот момент был немецкой факторией, а не как пишут "русские" баснописцы "древнерусским" городом.